En su orígen los niveles de Reiki estaban divididos en tres grados, y éste tipo de sistema de grados se parece al de las artes marciales y se utiliza de manera similar, ya que todo en Japón está muy estructurado.
Estos niveles son:
- Shoden
- Okuden
- Shinpiden
El nivel Shoden, es el nivel inicial y se dividía en dos días de aprendizaje. Sho simboliza a los iniciados y den al maestro. Los niveles se dividían en rotu-ko (6º grado); go-to (5º grado); yon-to (4º grado) y san-to (3º grado), siendo el grado menor de aprendizaje el roku-to.
El nivel Okuden se divide en dos partes Okuden Zenki y Okuden Koki, y para acceder a éste nivel de aprendizaje, el alumno debía comprener y sentir la técnica del byosen, dejándose guiar por ellos en los tratamientos y la enfermedad de las personas que trataban. En la primera parte del curso los alumnos aprenden los símbolos: significados, su forma, manera de activarlos (mantras) y aplicarlos; en la segunda etapa se aprende la técnica de la sanación a distancia.
El nivel Shinpiden, es el nivel de la "enseñanza mística " y se dividía en dos partes, el se Shihan-Kaku (asistente del maestro) y Shihan (maestro). El Shihan-Kaku estudiaba como se realizaba la reijú (bendición espiritual ó sintonización), pero estaba autorizado en forma limitada para poder poner en práctica sus conocimientos, siendo siempre observado por su Maestro, hasta que éste considere que el asistente esté preparado para asumir como Shihan. Este grado era ofrecido como un gran honor hacia el asistente, y no se obtenía con facilidad.
En la actualidad, se estudia Reiki Usui en sus cuatro niveles (primer nivel, segundo nivel, tercer nivel y maestría) como se lo enseña en occidente o bien hay dos cursos por los cuales uno puede obtener su "Maestría Japonesa " (técnicas y sintonizaciones originales ) y éstos son:
- Shinpiden Shihan (nivel del misterio)
- Satori Shihan (maestro de maestros) post-grado para Maestros de Reiki
En Shinpiden Shihan se aprende la escencia del Reiki originario de Japón enseñado por el Sensei Mikao Usui, desde la forma original de su pronunciación, significados, usos, deidad del Símbolo Maestro; la aplicación de Mudras, significado y su práctica; Meditaciones y Técnicas de Respiración. Las sintonizaciones para los niveles: Shoden; Okuden y Shinpiden y se aprende la Reijú de poder total original.
El cursode Saroti Shihan (Maestría Japonesa) es un post-grado para Maestros de Reiki (Maestros de Maestros), es una oportunidad para acceder a técnicas japonesas muy antiguas aplicadas por el Sensei Mikao Usui, como el mudra que utilizaba, sus símbolos e iniciaciones ancestrales.